La Asamblea General elige y nombra a su propia Mesa Ejecutiva, la cual estará constituida por: Presidente, Vicepresidente, Secretario de Actas, Tesorero y Secretario Ejecutivo (ex oficio). Además, elige y designa a los Directores de los Departamentos quienes junto con la Mesa Ejecutiva conforman el Comité Ejecutivo de AIPRAL.
El Comité Ejecutivo se reúne una vez al año, en lugar y fecha que el mismo Comité determine. El objetivo general de su tarea para el período 2007–2010 ha sido definido de la siguiente manera:
Fortalecer la comunión de fe reformada latinoamericana y caribeña, creando espacios para compartir las experiencias, la formación bíblico-teológica y social reafirmando el compromiso y testimonio cristiano relacionado con:
• la alianza por la justicia económica en la tierra facilitando a las Iglesias Reformadas el testimonio a favor de la justicia y la paz.
• la búsqueda de la renovación espiritual y litúrgico-musical a la luz de la teología reformada respetando la diversidad cultural,
generacional de idioma y de género.
• la unidad en la misión y ecumenicidad, la comunicación y la tolerancia.
» AGENCIA LATINOAMERICANA Y CARIBEÑA DE COMUNICACIÓN – ALC
» ASOCIACIÓN MUNDIAL PARA LA COMUNICACIÓN CRISTIANA
» COMUNION MUNDIAL DE IGLESIAS REFORMADAS
» CONSEJO LATINOAMERICANO DE IGLESIAS
» CONSEJO MUNDIAL DE IGLESIAS
» IGLESIA PRESBITERIANA – ESTADOS UNIDOS DE AMÉRICA (PC USA)
» IGLESIA REFORMADA EN AMÉRICA